ANALISIS PROTEIN PLASMODIUM FALCIPARUM MEROZOIT SURFACE PROTEIN-1 (PFMSP-1) PLASMODIUM FALCIPARUM UNTUK AKTIVASI SEL T-HELPER SECARA IN SILICO

Abstrak

Sampai saat ini vaksinasi dianggap sebagai cara paling efektif dalam mencegah malaria. Dewasa ini, dimungkinkan menggunakan informasi genomik untuk mempelajari perancangan vaksin secara in silico, tanpa perlu membiakan mikroorganisme pathogen. In silico adalah istilah yang digunakan untuk proses penelitian dengan memanfaatkan sistem komputer. Protein PFMSP-1 adalah salah satu jenis protein dari penyebab terjadinya malaria yang dapat dijadikan sebagai sumber kandidat vaksin untuk malaria. Tujuan penelitian ini adalah menganalisis protein PFMSP-1 sebagai sumber kandidat vakasin malaria melalui prediksi interaksi protein PFMPS-1 dengan MHC-II secara in silico. MHC-II merupakan protein yang bertanggung jawab dalam mengaktivasi sel B dalam menghasilkan antobodi dan sel memori melalui sel T penolong. Bahan utama yang digunakan adalah urutan asam amino protein PFMSP-1 dan perangkat lunak berbasis web IEDB-AR. Hasil analisis menunjukkan bahwa urutsan asam amino NFLGISFLLILMLIL (Asparagin, Fenilalanin, Leusin, Glysin, Isoleusin, Serin, Fenilanain, Leusin, Leusin, Isoleusin, Leusin, Metionin, Leusin, Isoleusin, Leusin). merupakan peptida yang potensial untuk mengaktivasi sel T helper.